Microbioma
Acronimo:
Tipo: Grupo emergente
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Categorías: LS2 Genetics, ?Omics?, Bioinformatics and Systems Biology
LS8 Ecology, Evolution and Environmental Biology
BVAE Biología Vegetal y Animal, Ecología
Coordinador:
Miembros:
Enlaces:
Lineas de investigación:
Estudio de la estructura y función de comunidades microbianas mediante técnicas de secuenciación masiva y biología computacional Estudio del microbioma rizosférico
Proyectos más relevantes:
Desarrollo de un modelo total de ensamblaje de comunidades microbianas mediante el uso conjunto de señal filogenética y experimentación avanzada in silico, in vitro e in vivo. PID2019-108797RB-I00. Retos (AEI) 01/06/2020 – 31/05/2023. IP: Daniel Aguirre de Cárcer MICROBIOMA MINIMO, GRUPOS FUNCIONALES Y OTUS DINAMICAS: UN NUEVO MARCO ANALITICO Y CONCEPTUAL PARA ABORDAR LA COMPLEJIDAD DEL PANMICROBIOMA INTESTINAL. MINECO (Plan Nacional). 30/12/2016 a 29/12/2019. IP: Daniel Aguirre de Cárcer. DETERMINANTES INMUNES DE LA ESTRUCTURA DEL MICROBIOMA. MINECO (Explora Ciencia). 01/09/2014 a 30/08/2015. IP: Daniel Aguirre de Cárcer.COOLVIROMES. EU-FP7. 01/09/2014 a 30/08/2015. IP:Daniel Aguirre de Cárcer.
Publicaciones más relevantes:
Daniel Aguirre de Cárcer (2019) A conceptual framework for the phylogenetically-constrained assembly of microbial communities. Microbiome. 7, 142. Daniel Aguirre de Carcer (2018) The human gut pan-microbiome presents a compositional core formed by discrete phylogenetic units. Scientific Reports 8: 14069. Daniel Aguirre de Cárcer (Corresponding), Bruno Hernáez, Alberto Rastrojo, Antonio Alcamí (2017) Infection with diverse immune-modulating poxviruses elicits different compositional shifts in the mouse gut microbiome. PlosOne 12(3): e0173697 Daniel Aguirre de Cárcer (Corresponding), Florent Angly, Antonio Alcamí (2015) Evaluation of viral genome assembly and diversity estimation in Deep metagenomes. BMC Genomics 15:989.Stephane Dray, Sandrine Pavoine, Daniel Aguirre de Cárcer (corresponding) (2014) Considering external information to improve the phylogenetic comparison of microbial communities: a new approach based on constrained Double Principal Coordinates Analysis (cDPCoA). Molecular Ecology Resources 15:242. Daniel Aguirre de Carcer; Alberto Lopez-Bueno; David Pearce; Antonio Alcamí (2015) Biodiversity and Distribution of Polar Freshwater DNA Viruses. Science Advances 1: e1400127.